Niebezproblemowo w mgnieniu oka oszacować koszt, z którym wiązałaby się księgowość online. Bardzo wiele zależy od indywidualnej oferty poszczególnych firm, jakie mogą oferować dość odmienną funkcjonalność swoich produktów. Nie da się ukryć, iż w zależności od branży przedsiębiorstwa mają zdecydowanie zróżnicowane oczekiwania wobec oprogramowania, jakie docelowo ma ułatwiać funkcjonowanie firmy. Pożądane byłoby zwrócić uwagę na to, aby program pozwalał na wygodną budowę listy kontrahentów, a zarówno ewidencjonowania przychodów tj. faktury i dokumenty wewnętrzne. Dość wielkie znaczenie ma zarówno szansa komfortowego ewidencjonowanie kosztów, dodawanie nowych produktów, a zarówno rozliczanie kosztów samochodów użytkowanych do celów firmowych.

Program księgowy online niesłychanie w wielu przypadkach posiada szereg ułatwień, do których zalicza się generowanie podatkowej księgi przychodów i rozchodów, rozliczanie składek do Zakładu Ubezpieczeń Społecznych, a zarówno rozliczania środków trwałych w formie amortyzacji zarówno jednorazowej, jak i miesięcznej. Zazwyczaj korzystanie z programu księgowego wiąże się z koniecznością wykupienia jednorazowej licencji, której koszt potrafi sięgać nawet kilku tysięcy złotych. Zdecydowanie bardziej konkurencyjną propozycję stanowi szansa wykupienia dostępu do programu w formie online, ponieważ nierzadko korzystanie z niego wiąże się z wydatkiem rzędu np. 50-150 zł rocznie. Większe koszty pojawiają się wówczas, gdy klienci oczekują wyższej funkcjonalności oprogramowania służącego do podstawowych czynności księgowych.